L'Ateneo è articolato in tre poli:
- Nel centro storico di Trento ci sono, a poca distanza l'uno dall'altro, i Dipartimenti di Sociologia e Ricerca Sociale, Economia e Management, Lettere e Filosofia, la Facoltà di Giurisprudenza, la Scuola di Studi Internazionali e il Centro Interdipartimentale di Scienze mediche - CISMed;
- Nel polo universitario di collina ci sono i Dipartimenti di Fisica, Matematica, Ingegneria civile ambientale e meccanica, Ingegneria industriale, Ingegneria e scienza dell'informazione, Dipartimento di Biologia Cellulare, Computazionale e Integrata - CIBIO
- Nel polo di Rovereto c'è il Dipartimento di Psicologia e scienze cognitive, nato nel 2004 come Facoltà di Scienze cognitive, unica in Italia a puntare sulle neuroscienze, un'area di studio e di ricerca innovativa e carica di futuro, e il CIMeC - Centro Interdipartimentale Mente/Cervello
L'offerta formativa si compone di corsi di studio, numerosi master di primo e di secondo livello, corsi di formazione avanzata e corsi di dottorato di ricerca
Le attività di ricerca si svolgono, oltre che nei dipartimenti, anche in numerosi centri di ricerca e di studio, tra i quali il Centro interdipartimentale Mente/Cervello (CIMeC), il Centro interdipartimentale in Scienze mediche (CISMed), il Centro Agricoltura Alimenti Ambiente (C3A) e la Scuola di Studi Internazionali (SSI).
Il territorio vanta diverse realtà di ricerca in partnership con l'Università, articolate in centri, progetti congiunti, spin off e start up.