UniTrento utilizza due sistemi di tassazione come previsto dalle leggi nazionali e della Provincia Autonoma di Trento.

Un sistema di tassazione si basa sull’indicatore ISEE e si applica alle persone italiane ed europee e di provenienza analoga (dette “parificate”). 

Il secondo sistema di tassazione si applica alle persone non europee residenti all’estero (dette “non-UE”) e si basa sul punteggio ottenuto al termine della procedura di ammissione al primo anno accademico. Negli anni successivi, l'importo delle tasse viene determinato in base ai risultati raggiunti. È un sistema che tiene conto del merito e non della condizione economica, per cui l’importo delle tasse può variare di anno in anno per ciascuno studente. 

Non è possibile passare da un sistema di tassazione all'altro: una persona che si immatricola come “non-UE residente all’estero” continuerà a pagare le tasse secondo il metodo di tassazione che si applica alle persone non-UE residenti all’estero per l’intera durata del suo corso di studi anche se decide di spostare la residenza in Italia.